La Asociación Villanúa confía la responsabilidad de la formación cristiana al Opus Dei, institución de la Iglesia Católica que fundó San Josemaría Escrivá de Balaguer en 1928. El mensaje del Opus Dei hace hincapié en el valor trascendental del trabajo bien realizado y de la realización de los deberes ordinarios de cada persona. Su influencia en la Asociación se manifiesta en multitud de detalles grandes y pequeños: la seriedad y exigencia en el estudio personal, el afán de convivir en libertad, el aprendizaje de la solidaridad y el servicio a los otros, el orden, el optimismo… que impregnan todas las actividades.